学历：博士
职称：教授
所属部门：植物学系
招生专业：发育生物学（硕士、博士、博士后）
电话: 0538-8242285
邮箱: HongjunL@sdau.edu.cn
个人简介
刘红军，男，1981年8月出生，黑龙江省友谊县人。博士、教授、博士生导师。“泰山学者”青年专家，玉米生殖发育与遗传改良团队成员。2005年和2008年在东北农业大学获得学士和硕士学位；2008年7月-2009年9月在中国农业科学院作物科学研究所（玉米产业技术体系首席办公室）工作；2009年9月-2013年7月于四川农业大学玉米研究所攻读玉米分子遗传博士学位，期间2010年9月-2012年9月，2013年7月-2013年12月受留学基金委和四川农业大学资助在美国爱荷华州立大学Thomas Lübberstedt教授课题组从事玉米分子遗传研究；2014年1月-2016年9月在中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究员课题组从事博士后研究工作；2016年9月到山东农业大学生命科学学院工作，加入作物生物学重点实验室作物发育分子生物学研究团队。在PNAS、Plant Biotechnology Journal和Communications Biology等主流杂志发表SCI文章16篇，其中第1及共同第1作者文章10，累计影响因子91.15，他引频次542次。主持自然科学基金面上项目2项、山东省泰山学者工程人才项目1项、山东省自然科学基金面上项目1项，山东农业大学人才引进启动项目1项，累计到账经费234万元。申请专利2项，参与审定国审玉米新品种“爱农707”1个，参编科学出版社及Studium出版社著作2项。
现为中国作物学会、遗传学会、美国遗传学会及植物学会会员；TAG，Plant Physiology, BMC Genomics, BMC Plant Biology及Frontiers in Plant Science等杂志审稿专家；自然科学基金评审专家；留学基金委评审专家。目前指导博士研究生3人，硕士研究生5人，已毕业研究生3人。
教学工作
承担本科生《植物学》和《植物学实验》等课程的年度教学工作。
研究方向
玉米是我国重要的粮食、饲料和经济作物，是重要的战略保障物资。种业巨头公司（先锋及孟山都）其核心的产业链即为玉米商业育种。近年来，高温、干旱、肥料过量施用和雾霾等一系列恶劣环境因子为玉米高产提出了严峻的考验，如何培育出高产优质多抗的玉米新品种成为基础科研领域和育种家的研究热点和难点。本人重点围绕玉米籽粒发育和杂种优势利用，感知外界环境所形成的一系列表型变化，结合正向遗传学和反向遗传学手段，筛选和构建一系列突变体和遗传作图群体，利用分子生物学、生物化学、组学和遗传统计模型，解析玉米籽粒发育和杂种优势生物学过程中关键基因的表达作用模式和遗传网络调控机制。主要包括：
（1）玉米籽粒发育突变体筛选和克隆。利用正向和反向遗传学，在大刍草、B73、W22、黄早四等骨干自交系背景上构建和筛选EMS、Mu类突变体，结合经典基因克隆技术图位克隆候选基因，解析玉米生殖发育过程中关键基因的遗传调控网络和作用机制；
（2）玉米杂种优势机理及分子标记辅助育种（MAS）探索和开发。构建杂种优势机理探索的遗传群体，结合本课题组现有的遗传定位群体和连锁关联群体，解析玉米杂种优势形成过程中的遗传作用模式和分子生物学功能；开发关键基因的功能标记，进行分子标记辅助育种和全基因组选择育种探索工作；
科研项目
1.山东农业大学人才引进启动资金：玉米籽粒分子生物学（72127），2016-2021，80万元，主持；
2.山东省自然科学基金面上项目：玉米褐色叶中脉突变体基因家族调控网络和品质性状遗传改良（ZR2017MC017），2017-2020，17万元，主持；
3.自然科学基金面上项目：玉米醇溶蛋白基因染色体重排和拷贝数变化的遗传解析（31771799），2018-2 021，59万元，主持；
4.自然科学基金面上项目：玉米百粒重主效QTL（Hgw1q1）克隆及分子机理解析（32072009），2018-2021，58万元，主持；
5.山东省政府，泰山学者工程，23943, 优质蛋白玉米基因组结构变异遗传解析，201901-202312、100万元，主持
6.山东农业大学建设优势创新团队：玉米突变体库构建与重要农艺性状基因鉴定及应用（564043）,2017-2020，主要参加人
研究专利
1. 沈亚欧; 杨珊; 林海建; 刘红军; 缪林; 潘光堂; 一种新型的转基因专用茎尖分生组织培养皿，2013-05-27，中国，ZL 2013 2 0295177.X.
2. 巫永睿; 刘红军;孙传龙；功能连锁标记0707-1及其在玉米种质改良中的应用，2020.10.27，中国，ZL 2016 1 0133152.8.
发表论文
1. Liu Hongjun †, Qin Cheng †, Chen Zhe †…… Zhang Zhiming* and Pan Guangtang*. Identification of miRNAs and their target genes in developing maize ears by combined small RNA and degradome sequencing. BMC Genomics, 2014, 15:25. (2区，IF=3.8，引用68次)
2. Liu Hongjun†, Yang Xuerong†, Liao Xinhui†……Zhang Zhiming* and Pan Guangtang*. Genome-wide comparative analysis of digital gene expression tag profiles during maize ear development. Genomics, 2015, 106(1):52-60. (3区，IF=2.77，引用12次)
3. Liu Hongjun†, Niu Yongchao†, Pedro J. Gonzalez-Portilla†, Zhou Huangkai†, Wang Liya, Zuo Tao, Qin Cheng, Tai Shuaishuai, Constantin Jansen, Shen Yaou, Lin Haijian, Michael Lee, Doreen Ware, Zhang Zhiming*, Thomas Lübberstedt* and Pan Guangtang*. An ultra-high-density map as a community resource for discerning the genetic basis of quantitative traits in maize. BMC Genomics, 2015, 16(1):1078. (2区，IF=3.8，引用20次)
4. Liu Hongjun†, Zhou Huangkai†, Wu Yongsheng†……Thomas Lübberstedt and Pan Guangtang*. The impact of genetic relationship and linkage disequilibrium on genomic selection. PloS One, 2015, 10(7):e0132379. (3区，IF=3.02，引用12次)
5. Liu Hongjun†, Shi Junpeng†……Han Bin, Lai Jinsheng and Wu Yongrui*. Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification in quality protein maize. PNAS, 2016, 113(18):201601352.(1区，IF=9.412，引用62次)
6. Liu Hongjun†, Ma Langlang†, Yang Xuerong†……Wu Yongrui and Shen Yaou*. Integrative analyses of DNA methylation, mRNA, and small RNA during dedifferentiation of maize embryo. BMC Plant Biology, 2017, 17(1):105. (2区，IF=4.03，引用10次)
7. Liu Hongjun†, Zhang Lin †……Michael Lee, Thomas Lübberstedt and Zhao Guangwu*. Quantitative trait locus analysis for deep-sowing germination ability in the maize IBM Syn10 DH population. Frontiers in Plant Science, 2017, 8:813. (2区，IF=4.47，引用10次)
8. Liu Hongjun†, Huang Yongcai†, Li Xiaohan†…… David R. Holding and Wu Yongrui*. High frequency DNA rearrangement at qγ27 creates a novel allele for Quality Protein Maize breeding. Communications Biology, 2019, 2: 460. (1区，IF=6.268，引用1次)
9. Liu Hongjun†, Wang Qin†……Lai Jinsheng, Zhang XianSheng* and Huang Xuehui*. Genome-wide identification and analysis of heterotic loci in three maize hybrids. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(1):185–194. (1区，IF=9.803，引用11次)
10. Constantin Jansen†, Zhang Yongzhong†*, Liu Hongjun†, Pedro J. Gonzalez Portilla†,•……Thomas Lübberstedt*. Genetic and agronomic assessment of cob traits in corn under low and normal nitrogen management conditions. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(7):1231-1242.(Co-first author). (1区，IF=4.02，引用8次)
11. Yin Fuqiang†, Qin Cheng†, Gao Jian†, Liu Ming, Luo Xirong, Zhang Wenyou, Liu Hongjun……Pan Guangtang*. Genome-wide identification and analysis of drought-responsive genes and microRNAs in tobacco. IJMS, 2015, 16(3):5714-5740. (2区，IF=4.32，引用18次)
12. Liu Sanzhen†*, Zheng Jun†, Pierre Migeon†, Ren Jie, Hu Ying, He Cheng, Liu Hongjun…… Wang Guoying*. Unbiased K-mer analyses reveal marked changes in copy number of highly repetitive sequences during maize domestication and improvement. Scientific Reports, 2017, 7:42444. (3区，IF=4.29，引用4次)
13. Ignacio Trucillo Silva†, Hari Kishan R. Abbaraju, Lynne P. Fallis, Liu Hongjun, Michael Lee* and Kanwarpal S. Dhugga*. Biochemical and genetic analyses of N metabolism in maize testcross seedlings: 1. Leaves. Theoretical and Applied Genetics, 2017, 130(7):1453-1466. (1区，IF=4.02，引用3次)
14. Ignacio Trucillo Silva†, Hari Kishan R. Abbaraju, Lynne P. Fallis, Liu Hongjun, Michael Lee* and Kanwarpal S. Dhugga*. Biochemical and genetic analyses of N metabolism in maize testcross seedlings: 2. Roots. Theoretical and Applied Genetics, 2018, 131(6):1191-12. (1区，IF=4.02，引用1次)
15. Li Changsheng†, Xiang Xiaoli†……Liu Hongjun…… Wu Yongrui* and Wang Wenqin*. Long-read sequencing reveals genomic structural variations that underlie creation of quality protein maize. Nature Communications, 2020, 11: 17. (1区，IF=12.19，引用1次)
著作教材
1. Yongsheng Wu, Ursulak Frei, Hongjun Liu, Gerld De La Fuente, Kaijian Huang, Yuanwen Wei and Thomas Lübberstedt. Combining Genomic Selection and Doubled Haploid Technology Increases Efficiency of Maize Breeding. Biotechnology Volume2 plant breeding. 2014, ISSN:1-62699-015-8
2. 陈泽辉，刘文欣，雍红军，刘红军，陈绍江. 2019, 玉米育种的数量遗传学, 科学出版社.
本课题组依托作物学重点实验室平台，结合玉米种业关注的科学问题开展研究，团队拥有丰富的分子遗传和 功能基因组研究基础，欢迎有志之士报考本课题组研究生（硕士、博士）和从事博士后研究工作，为未来玉米产业添砖加瓦！
联系方式：HongjunL@sdau.edu.cn